本署位居台灣東部，管轄區域為花蓮縣及台東縣，轄區內共有29個鄉鎮市 ( 花蓮縣13個，台東縣16個 ) ，轄內人口約53萬1千餘人 ( 花蓮縣約31萬9千餘人，台東縣約21萬2千餘人) ，管轄面積共8,141平方公里 ( 花蓮縣4,628平方公里，台東縣3,513平方公里 ) ，地形狹長，倚山面海。
